La Ossigeno Ozono Terapia in fisiatria è indicata nella malattia di De Quervain, nelle tendinopatie (per esempio tendine di achille, periartrite scapolo-omerale, epicondiliti (gomito del tennista)).
Rispondono molto bene le entesopatie, come la epicondilite e la epitrocleite, ma anche le borsiti.
L’ossigeno ozonoterapia, inoltre, è utilizzata nell’ambito della riabilitazione neuromotoria e post-operatoria, migliorando notevolmente i tempi di recupero dell’intervento chirurgico, per esempio dopo un intervento di protesi al ginocchio o d’anca, nonché nella ricostruzione della cuffia dei rotatori della spalla. 
L’ozonoterapia è un valido supporto nei casi di fibromialgia.